Omicron, les nouvelles variantes de virus (2023)

Ce que l'on sait d'Omicron, la nouvelle variante du COVID-19 en Afrique du Sud

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a qualifié une nouvelle version du coronavirus découverte en Afrique du Sud de "variante préoccupante". L'OMS a nommé la variante Omicron et a déclaré que la première infection connue provenait d'un échantillon prélevé le 9 novembre.

Les scientifiques ont déclaré que la variante, qui porte également le nom de B.1.1.529, est à l'origine d'un récent pic d'infections au COVID-19 dans le Gauteng, la province la plus peuplée du pays.

Un expert dit que vous n'avez pas encore à vous soucier de la nouvelle variante COVID-19

On ne sait pas d'où vient réellement la nouvelle variante, mais elle a été découverte pour la première fois par des scientifiques en Afrique du Sud et a également été observée chez des voyageurs à Hong Kong et au Botswana.

Le secrétaire à la Santé, Joe Phaahla, a déclaré que la variante était liée à une "augmentation exponentielle" des cas ces derniers jours, bien que les experts tentent toujours de déterminer si la nouvelle variante est réellement à blâmer.

D'un peu plus de 200 nouveaux cas confirmés par jour ces dernières semaines, le nombre de nouveaux cas quotidiens en Afrique du Sud est passé à plus de 1200 mercredi et à 2465 un jour plus tard.Pour expliquer le pic soudain de cas, les scientifiques ont examiné des échantillons de virus de l'épidémie. et découvert la nouvelle variante.

Les experts sud-africains ont déclaré qu'il n'y avait jusqu'à présent aucune preuve que la variante provoque une maladie plus grave ou inhabituelle, notant que certaines personnes infectées, comme d'autres variantes, ne présentent aucun symptôme.

La variante a jusqu'à présent été identifiée en Afrique du Sud, au Botswana, à Hong Kong et en Belgique.

Un spécimen du premier cas connu de la variante en Afrique du Sud a été prélevé le 9 novembre, a annoncé vendredi l'OMS. Maintenant, le nombre de cas variants semble augmenter dans presque toutes les provinces du pays, a déclaré l'OMS.

L'Afrique du Sud compte actuellement moins de 36% de sa population adulte entièrement vaccinée et le nombre de nouveaux vaccins a diminué ces derniers jours, selon le ministère de la Santé du pays.

Les responsables sud-africains ont également initialement déclaré qu'il y avait eu un cas confirmé chez un voyageur d'Afrique du Sud à Hong Kong. Vendredi, les responsables de la santé de Hong Kong ont identifié un deuxième cas de la variante parmi les voyageurs de retour au même étage d'un hôtel de quarantaine désigné.

Les responsables de la santé ont ordonné à au moins 12 personnes dans des pièces voisines de subir un test COVID-19 obligatoire et une quarantaine de deux semaines dans un centre gouvernemental. Vendredi également, le gouvernement belge a déclaré qu'une personne récemment arrivée d'Égypte et non vaccinée avait été testée positive pour la variante, marquant le premier cas en Europe.

Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies a déclaré vendredi qu'il existait un risque "élevé à très élevé" de propagation en Europe, compte tenu du "potentiel d'échappement immunologique de la variante et de l'avantage de transmission potentiellement accru par rapport à Delta".

Pourquoi les scientifiques s'inquiètent-ils de cette nouvelle variante ?

Il semble avoir un nombre élevé de mutations – environ 30 – dans la protéine de pointe du coronavirus qui pourraient affecter la facilité avec laquelle il se propage aux humains. L'OMS a déclaré qu'un certain nombre de mutations étaient "préoccupantes" et que la souche présentait un niveau élevé de transmissibilité.

"Cette variante a été détectée plus rapidement que les poussées précédentes, ce qui suggère que cette variante pourrait avoir un avantage de croissance."

François Balloux, directeur de l'Institut de génétique de l'University College de Londres, a déclaré que le taux élevé d'infections au COVID-19 en Afrique du Sud, et dans la province de Gauteng en particulier, était inquiétant.

"Le plus grand risque est que (cette variante) réinfecte mieux les humains et soit plus transmissible et virulente", a-t-il déclaré dans un communiqué. Mais Balloux a déclaré qu'il n'était pas clair à ce stade si c'était parce que le virus était intrinsèquement plus contagieux.

Il a souligné que bien que la nouvelle variante soit capable de réinfecter des personnes précédemment immunisées, "nous ne pouvons pas faire de prédictions fiables sur la transmissibilité ou la virulence attendue sur la base de sa seule constitution génétique.

La variante delta a entraîné une poussée estivale virulente de COVID-19 en Inde et aux États-Unis, et a contribué à alimenter les récentes poussées à travers l'Europe. Un document des Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis indiquait que la variante Delta était à peu près aussi transmissible que la varicelle.

Maintenant, le nombre de cas en Afrique du Sud est assez faible, il peut donc y avoir d'autres raisons aussi, pas seulement parce que c'est plus facilement transmissible. Mais la vitesse à laquelle il a décollé est vraiment différente de tout ce que nous avons vu auparavant.

Les responsables de l'OMS ont également déclaré dans leur déclaration de vendredi que des preuves préliminaires suggèrent qu'Omicron présente également un risque plus élevé de réinfection par rapport à d'autres variantes préoccupantes.

Un vaccin est-il résistant à la variante Omicron ?

Sharon Peacock, qui a dirigé le séquençage génétique du COVID-19 au Royaume-Uni à l'Université de Cambridge, a déclaré que les données suggèrent jusqu'à présent que la nouvelle variante a des mutations "compatibles avec une transmissibilité améliorée", mais a déclaré que "l'importance de nombreuses mutations" n'est pas encore connue. Elle a déclaré qu'il faudrait plusieurs semaines pour effectuer les tests de laboratoire nécessaires pour déterminer si les vaccins actuels contre le coronavirus sont toujours efficaces contre la nouvelle variante.

Moderna a déclaré qu'il travaillait rapidement pour tester la capacité de son vaccin à neutraliser la variante, et des données sont attendues dans les semaines à venir.

La souche contient des mutations "observées dans la variante delta dont on pense qu'elles augmentent la transmissibilité et des mutations observées dans les variantes bêta et delta qui sont censées augmenter l'immunité Boost", a déclaré Moderna. "La combinaison de mutations pose un risque potentiel important d'accélérer le déclin de l'immunité naturelle et induite par le vaccin."

Si le vaccin et le rappel actuels contre la variante ne suffisent pas, une solution possible consiste à charger les gens avec une dose plus élevée que Moderna teste. La société évalue également deux candidats de rappel multivalents pour voir s'ils offrent une meilleure protection contre Omicron - tous deux contenant certaines des mutations virales présentes dans la variante.

Moderna a déclaré qu'il testait également un booster spécifique à Omicron.

"Depuis plusieurs jours, nous travaillons au plus vite pour mettre en place notre stratégie face à cette variante", a déclaré vendredi Stéphane Bancel, PDG de Moderna, dans un communiqué.

AstraZeneca a également déclaré vouloir comprendre l'impact d'Omicron sur son vaccin.

AstraZeneca mène également déjà des recherches dans des endroits où la variante a été identifiée, à savoir au Botswana et à Eswatini, ce qui nous permettra de collecter des données réelles de Vaxzevria contre cette nouvelle variante du virus », a déclaré vendredi un porte-parole de la société.

La société a également annoncé qu'elle testait son traitement par anticorps AZD7442 contre la variante.

Les scientifiques de BioNTech, la société allemande qui s'est associée à Pfizer pour fabriquer son vaccin COVID-19, étudient également l'impact de la variante sur leur vaccination. Les données sont attendues dans les prochaines semaines.

Un porte-parole de Johnson & Johnson a déclaré à CNN dans un communiqué que la société testait également l'efficacité de son vaccin contre Omicron.

Où la variante sud-africaine s'est-elle propagée ?

En réponse à la nouvelle variante, un certain nombre de pays ont restreint les voyages en provenance d'Afrique du Sud, notamment les États-Unis, l'Allemagne et le Canada.

Plusieurs pays ont déjà détecté un cas, dont le Botswana, Hong Kong, Israël et la Belgique.

L'Australie a annoncé samedi des changements aux règles frontalières. Les voyageurs d'Afrique du Sud, de Namibie, du Zimbabwe, du Botswana, du Lesotho, d'Eswatini, des Seychelles, du Malawi et du Mozambique doivent tous effectuer une quarantaine supervisée de 14 jours.

Pendant ce temps, certains États et territoires ont commencé à imposer des restrictions supplémentaires aux voyageurs étrangers en provenance de n'importe quel pays du monde, les obligeant à s'isoler chez eux ou dans leur logement pendant 72 heures et à subir des tests supplémentaires.

Balloux, de l'University College London, a déclaré que si la nouvelle variante s'avère plus contagieuse que Delta, les nouvelles restrictions auront peu d'impact, mais elles pourraient donner à la Grande-Bretagne plus de temps pour augmenter les taux de vaccination et introduire d'autres interventions possibles.

Comment est née cette nouvelle variante ?

Le coronavirus mute au fur et à mesure qu'il se propage, et de nombreuses nouvelles variantes, y compris celles présentant des modifications génétiques inquiétantes, disparaissent souvent tout simplement.

Les scientifiques surveillent les séquences de COVID-19 à la recherche de mutations qui pourraient rendre la maladie plus contagieuse ou mortelle, mais ils ne peuvent pas le dire en regardant simplement le virus. Ils doivent comparer le schéma de la maladie dans les épidémies aux séquences génétiques et déterminer s'il existe un lien réel peut prendre du temps.

Certains scientifiques ont émis l'hypothèse que la nouvelle variante est apparue en raison du grand nombre de mutations chez un patient immunodéprimé.